Behandeling van de volgende aandoeningen veroorzaakt door bacteriën die gevoelig zijn voor doxycycline:
Honden: Rinitis (ontsteking van de neusslijmvliezen) veroorzaakt door Bordetella bronchiseptica en Pasteurella spp.; Bronchopneumonie (ontsteking van de bronchiën met lobulaire ontsteking van de longen) veroorzaakt door Bordetella spp. en Pasteurella spp.; Interstitiële nefritis (ontsteking van het interstitium een deel van het nierweefsel) veroorzaakt door Leptospira spp.;
Katten: Infecties van de luchtwegen veroorzaakt door Bordetella bronchiseptica, Chlamydophila felis, Pasteurella spp.